Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99KU6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99KU6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99KU6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q99KU6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q99KU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q99KU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q99KU6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q99KU6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q99KU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q99KU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q99KU6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q99KU6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms