Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ciao1Q99KN2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ciao1Q99KN2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms