Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed9Q99KF1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed9Q99KF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms