Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dok4Q99KE3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dok4Q99KE3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms