Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pls3Q99K51 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pls3Q99K51 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms