Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ufsp2Q99K23 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ufsp2Q99K23 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms