Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddb2Q99J79 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddb2Q99J79 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms