Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Def8Q99J78 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Def8Q99J78 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms