Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim11aQ99J19 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms