Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CsprsQ99388 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CsprsQ99388 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms