Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIGSQ96S52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIGSQ96S52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms