Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb6Q922F4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb6Q922F4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms