Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mthfd1Q922D8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mthfd1Q922D8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms