Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b3Q921M3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sf3b3Q921M3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms