Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Odf3Q920N1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms