Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Afg3l1Q920A7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Afg3l1Q920A7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms