Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx18Q91ZR2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms