Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pde6cQ91ZQ1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Pde6cQ91ZQ1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Pde6cQ91ZQ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde6cQ91ZQ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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