Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn8Q91VA3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn8Q91VA3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms