Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Odf4Q8VI88 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms