Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cabp4Q8VHC5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp4Q8VHC5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms