Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Srsf4Q8VE97 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Srsf4Q8VE97 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms