Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Med17Q8VCD5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Med17Q8VCD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms