Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc58Q8R3Q6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms