Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc12Q8R344 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc12Q8R344 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms