Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrrtm1Q8K377 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms