Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbm48Q8K2X2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms