Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paf1Q8K2T8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paf1Q8K2T8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms