Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil3Q8K203 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms