Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sde2Q8K1J5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sde2Q8K1J5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms