Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt33aQ8K0Y2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt33aQ8K0Y2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms