Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lmbrd1Q8K0B2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lmbrd1Q8K0B2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms