Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp1Q8K021 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp1Q8K021 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms