Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsnQ8CIT9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsnQ8CIT9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms