Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rbm28Q8CGC6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rbm28Q8CGC6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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