Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cdc34Q8CFI2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cdc34Q8CFI2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms