Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
9030612E09RikQ8CE20 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
9030612E09RikQ8CE20 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
9030612E09RikQ8CE20 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms