Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc87Q8CDL9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms