Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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