Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf170Q8CBG9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf170Q8CBG9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms