Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm9958Q8C9U4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm9958Q8C9U4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms