Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Spef2Q8C9J3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spef2Q8C9J3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Spef2Q8C9J3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms