Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Rfx6Q8C7R7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rfx6Q8C7R7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rfx6Q8C7R7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rfx6Q8C7R7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rfx6Q8C7R7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rfx6Q8C7R7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rfx6Q8C7R7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Rfx6Q8C7R7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rfx6Q8C7R7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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