Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930504O13RikQ8C5Z9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930504O13RikQ8C5Z9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms