Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cwc22Q8C5N3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cwc22Q8C5N3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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