Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Amigo3Q8C2S7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Amigo3Q8C2S7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms