Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp5Q8BX09 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp5Q8BX09 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms