Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tspan12Q8BKT6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms