Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ubash3bQ8BGG7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms