Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3bgrl2Q8BG73 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh3bgrl2Q8BG73 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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